Un dels elements que distingeix la Universitat de qualsevol altre centre educatiu és la recerca. La UIB, pionera en recerca interdisciplinar, ha consolidat els darrers anys un gran prestigi com a institució investigadora i se situa al capdavant del rànquing estatal universitari quant al nombre de treballs científics generats en relació amb el nombre total d’investigadors. Actualment, compta amb 107 grups de recerca distribuïts en 21 àrees segons la classificació de l’Agència Nacional d’Avaluació i Prospectiva, 8 laboratoris de recerca, 3 instituts universitaris de recerca (Institut Universitari d’Investigació en Ciències de la Salut, Institut Mediterrani d’Estudis Avançats, Institut de Física Interdisciplinària i Sistemes Complexos), un institut de recerca propi (Centre de Recerca Econòmica), 45 beques de col·laboració vinculades a projectes de recerca, 25 beques de formació de personal investigador, 13 beques de formació de professorat universitari, 83 beques predoctorals, 103 contractes d’investigació, 14 projectes finançats per la Unió Europea, 192 projectes finançats pel Pla nacional de recerca, desenvolupament i innovació tecnològica, una mitjana de 45 tesis doctorals defensades per any acadèmic i 30 patents.