La presència de la Universitat arriba a totes les illes. Des de 1996, la UIB té dues seus fora de Mallorca, a Eivissa i a Menorca, dotades de la part administrativa i organitzativa necessària per descentralitzar la universitat del campus de Palma. A partir de la implantació del projecte Campus Extens, l’any 1997, centenars d’estudiants eivissencs, formenterencs i menorquins ja no s’han hagut de desplaçar a Mallorca per seguir els estudis universitaris.

La Seu universitària de Menorca és a Alaior, al centre geogràfic de l’illa. La d’Eivissa i Formentera és a Vila. Des d’aquí els alumnes poden cursar una de les especialitats dels estudis de mestre i les diplomatures en ciències empresarials i infermeria, entre d’altres. A més dels estudis reglats, les seus ofereixen altres cursos de formació a tota la població, com els cursos de reciclatge de català, el Curs d’Aptitud Pedagògica, la Universitat Oberta per a Majors, universitats d’estiu, conferències i seminaris. Aquestes seus disposen de serveis administratius i biblioteques amb recursos diversos.