Juan Montes de Oca és llicenciat en Ciències, especialitat Informàtica, per la Universitat Autònoma de Barcelona (1987). Durant 1988 i 1990 realitza els cursos de doctorat en Infografia i Intel·ligència Artificial a la Universitat Autònoma de Barcelona i la Universitat de les Illes Balears (UIB). El 1998 presenta la memòria d'investigació 'Una aplicació per a la parla i expressió de personatges sintètics 3D' a la UIB.

Des de 1988 és professor titular del departament de Matemàtiques i Informàtica de la UIB.

El 1989 realitza una estada a l'Institut d'investigació INRIA-Roquencourt (França) formant part del projecte SYNTIM. El 1990 participa en el desenvolupament de noves funcionalitats del programari d'animació 3D de BSCA a Paris (França).

El 1990 forma part de l'equip fundador del Màster d'animació 3D MA ISCA, dins del programa MEDIA de la CEE, i des de 1995 fins al dia d'avui, assumeix la direcció del mateix. El màster MA ISCA ha estat reconegut a través d'innombrables premis i nominacions internacionals.

El 1995 crea i dirigeix, fins al dia d'avui, la unitat LADAT d'animació i tecnologies audiovisuals de la UIB, les funcionalitats se centren en la formació, realització, investigació i desenvolupament en l'àrea de creació audiovisual tecnològica.

Ha participat en múltiples projectes d'investigació i formació europeus sota el marc de la CEE.

El 2008 rep el premi Mons Digitals, per la seva contribució a l'animació per ordinador, i és nomenat acadèmic numerari de la Reial Acadèmia de Belles Arts de Sant Sebastià de les Illes Balears.