Margalida Capellà i Roig ha desenvolupat la seva activitat docent i investigadora principalment en l'àmbit de la Universitat de les Illes Balears. Ha exercit com a docent des de 1997 en l'àrea de Dret internacional públic i Relacions internacionals d'aquesta Universitat, ocupant progressivament les categories professionals d'ajudant, ajudant doctora i professora contractada doctora. Actualment és professora titular de dret internacional públic (2022). Ha impartit i imparteix en l'actualitat docència en estudis de Llicenciatura, Grau, Postgrau i doctorat a la UIB.

És doctora des de 2002 i ha exercit la seva activitat investigadora en el camp del Dret internacional penal i del Dret internacional dels drets humans, desenvolupant la seva formació amb diverses estades a centres de recerca a l'estranger (París, Cambridge, Estrasburg, Cuba).

Ha compaginat la seva activitat docent i investigadora amb diversos càrrecs a la UIB (Subdirectora del Graduat en seguretat i ciències policials UIB, Responsable de col·lectius vulnerables de l'Oficina d'Igualtat UIB) Presidenta del Comitè d'empresa) i ha estat diputada al Parlament balear (2015-2017). En l'actualitat és directora de la Clínica Jurídica de la UIB i també directora del LIDIB (Laboratori interdisciplinari de Drets i Llibertats de les Illes Balears - Human Rights Lab). És Presidenta de la Junta de Personal Docent i Investigador de la Universitat de les Illes Balears des de maig de 2023.