Els instituts universitaris de recerca són centres dedicats a la recerca científica i tècnica o a la creació artística. Podran organitzar i desenvolupar programes i estudis de doctorat i de postgrau segons els procediments previst en els estatuts i proporcionar assessorament tècnic a l'àmbit de les seves competències.

Normativa reguladora dels Instituts Universitaris de Recerca: Acord normatiu 12843/2018, de 24 de juliol (FOU núm. 468).

Instituts mixtos

• IFISC, Institut de Física Interdisciplinària i Sistemes Complexos - Personal
  (UIB - Consell Superior d'Investigacions Científiques)
• IMEDEA, Institut Mediterrani d'Estudis Avançats - Personal
  (UIB - Consell Superior d'Investigacions Científiques)

Instituts propis

• IAC³, Institut d'Aplicacions Computacionals de Codi Comunitari de la UIB - Personal
• IEHM, Institut d’Estudis Hispànics en la Modernitat - Personal
• IRIE, Institut de Recerca i Innovació Educativa - Personal
• IUNICS, Institut Universitari d'Investigacions en Ciències de la Salut - Personal
• INAGEA, Institut d'Investigacions Agroambientals i d'Economia de l'Aigua - Personal 
• IAIB, Institut d'Investigació en Intel·ligència Artificial